Tæl A, T, C, G, N og "-" i en fil med en enkel Unix-kommando - Trin-for-trin guide

Hvordan tælles A's, T's, C's, G's, N's og "-" tegn i en fil ved hjælp af en hurtig Unix-kommando?

For at tælle forekomsten af A, T, C, G, N og "-" i en fil med Unix-kommandoer, kan du bruge kombinationen af `grep` og `wc` kommandoerne som beskrevet i trin-for-trin guiden.

Sådan tælles A's, T's, C's, G's, N's og "-" tegn i en fil ved hjælp af en hurtig Unix-kommando

For at tælle forekomsten af specifikke tegn som A, T, C, G, N og "-" i en fil ved hjælp af Unix-kommandoer, kan du bruge grep og wc kommandoerne. Her er en trin-for-trin guide:

  1. Åbn terminalen.

  2. Brug følgende kommandoer til at tælle hvert tegn:

    • grep -o 'A' filnavn | wc -l - Tæller antallet af 'A' i filen.
    • grep -o 'T' filnavn | wc -l - Tæller antallet af 'T' i filen.
    • grep -o 'C' filnavn | wc -l - Tæller antallet af 'C' i filen.
    • grep -o 'G' filnavn | wc -l - Tæller antallet af 'G' i filen.
    • grep -o 'N' filnavn | wc -l - Tæller antallet af 'N' i filen.
    • grep -o '-' filnavn | wc -l - Tæller antallet af '-' i filen.
  3. Erstat filnavn med navnet på din fil.

Disse kommandoer fungerer ved at:

  • grep -o 'tegn' filnavn - Finder og udskriver hver forekomst af det specifikke tegn på en ny linje.
  • wc -l - Tæller antallet af linjer, som svarer til antallet af forekomster af tegnet.

Ved at kombinere disse kommandoer kan du hurtigt og effektivt tælle forekomsten af specifikke tegn i en fil.